مساعد أبحاث ما بعد الدكتوراه (م / و / د) - معلوماتية التنوع البيولوجي
مجموعة Leibniz Institute DSMZ الألمانية للكائنات الحية الدقيقة والثقافات الخلوية
جامعة حكومية (المانيا), تصفح الفرص المماثلة
ar
جامعة حكومية (المانيا), تصفح الفرص المماثلة
يقدم معهد Leibniz-Institute DSMZ - الكائنات الحية الدقيقة للمجموعة الألمانية وثقافات الخلايا المحدودة ، براونشفايغ موقع
مساعد أبحاث ما بعد الدكتوراه (م / و / د)
معلوماتية التنوع البيولوجي
في قسم المعلوماتية الحيوية (د. Boyke Bunk). سيتم تحديد الموعد مبدئيًا لمدة عامين بمستوى راتب وفقًا لـ TV-L 13 ، ولكنه مفتوح للتمديد. يتم تقديم الوظيفة بدوام كامل (39،8 ساعة في الأسبوع) وليست مناسبة للعمل بدوام جزئي.
يعد معهد لايبنيز DSMZ أحد أكبر مراكز الموارد الحيوية في العالم. تم تجهيز المعهد بأحدث الأجهزة للعمل الميكروبيولوجي والكيميائي والجزيئي بما في ذلك تسلسل الجيل التالي الخاص به ، وعلم الأيض ، ومنشأة أساسية للمعلومات الحيوية.
بالنسبة للتنوع الميكروبي الجزيئي ، تتوفر منصات تسلسل القراءة الطويلة والقصيرة (PacBio Sequel IIe ، Illumina NextSeq 2000). تشمل المهام الأساسية للوظيفة المُعلن عنها الاستكشاف الكمي والتصنيفي والوظيفي للتنوع الميكروبي على أساس بيانات الميتاجينوم وبيانات الترانسكربتوم ، ولكن أيضًا من أمبليكون 16S / ITS. فيما يتعلق بالمعلوماتية الحيوية ، تتمثل مهمتك في مرافقة الانتقال من دراسات الميتاجينوم القصيرة التي كان يهيمن عليها القراءة سابقًا إلى مناهج القراءة الطويلة. وفقًا لذلك ، يجب تطوير خطوط أنابيب التحليل المبتكرة ودعم أعمال المشروع الجارية. تتوفر بيئة خادم HPC مخصصة (> 2000 مركز CPU ، وتخزين مركزي 4.5 PB) لأنشطتك.
المؤهلات الرئيسية للتوظيف هي المعرفة المتعمقة ببيانات NGS (Illumina و PacBio و Oxford Nanopore) وبرامج تحليل التسلسل الأساسية (QC ، والتصفية ، وإجراءات القطع). هناك حاجة إلى خبرة مثبتة في مجال تجميع الميتاجينوم (مثل MEGAHIT و IDBA و metaSPAdes) و binning metagenomic (MaxBin2 و MetaBAT وما إلى ذلك). فيما يتعلق بتحليلات 16S (amplicon) ، يلزم معرفة برنامج تحليل التنوع المشترك (QIIME و MEGA و ARB وما إلى ذلك) وقواعد البيانات ذات الصلة (NCBI و SILVA و RDP و Greengenes و UNITE). علاوة على ذلك ، فإن المعرفة الواسعة بلغة برمجة واحدة على الأقل (Python و Java و C و Perl) ، بالإضافة إلى التعامل الكفء مع Linux وسطر الأوامر ، هي مهارات مطلوبة. أخيرًا ، من المتوقع التعامل الكفء مع البيانات من مستودعات وأرشيف التسلسل المركزي. الخبرة في التعامل مع بيئات HPC مثل SLURM وكذلك التعامل مع البرامج الإحصائية R مفيدة.
تسعى معاهد جمعية لايبنيز إلى زيادة نسبة العالمات. سيتم اختيار المتقدمين ذوي الإعاقة مع نفس المؤهلات بشكل تفضيلي. DSMZ هو صاحب فرص عمل متكافئ ، ويدعم التطوير الوظيفي المتوازن بين العمل والحياة المهنية ، ويحمل شهادة تدقيق beruf und familie®.
لمزيد من المعلومات ، يرجى الاتصال بالدكتور Boyke Bunk (boyke.bunk@dsmz.de ؛ الهاتف: 322-2616 49-531 ++).
يرجى إرسال مستندات التقديم الكاملة بما في ذلك السيرة الذاتية ، وخطاب التحفيز ، وملخص لأطروحة الماجستير / الدكتوراه ، ونسخ من الشهادات ، وقائمة النشر ، وثلاثة منشورات تمثيلية واثنين من الدلائل المرجعية مع رقم الطلب 01/21 إلى
Leibniz-Institut DSMZ-Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH
- Personalabteilung -
Inhoffenstraße 7B
38124 براونشفايغ
أو كملف pdf واحد إلى bewerbung@dsmz.de
نرحب بطلبات التقديم باللغة الألمانية أو الإنجليزية.
الموعد النهائي لتقديم هذا الطلب هو 20 فبراير 2021.
اختر البلد الذي توّد السفر إليه للدراسة مجانا أو العمل أو التطوع
