ar

مواقع أبحاث الوراثة المضيفة لـ COVID-19

مواقع أبحاث الوراثة المضيفة لـ COVID-19

جامعة تورنتو

جامعة تورنتو

جامعة حكومية, تصفح الفرص المماثلة

تفاصيل الفرصة

المكافأة الإجمالية
0 $
جامعة حكومية
آخر موعد للتقديم
11 فيفري 2021
المستوى التعليمي
نوع الفرصة
التخصصات
تمويل الفرصة
غير ممولة
الدول المؤهلة
هذه الفرصة متوفرة لجميع البلدان
المنطقة المؤهلة
جميع المناطق

حول شبكة الجينوم الكندية COVID

في 23 أبريل 2020 ، خصصت الحكومة الفيدرالية 40 مليون دولار ( http://www.cgen.ca/nr-april-23-2020 ) لدعم إطلاق جينوم كندا لشبكة جينوم COVID الكندية المشكلة حديثًا (CanCOGeN). بصفتها المنشأة الوطنية الكندية لتسلسل الجينوم والتحليل ، ستقود CGEn مبادرة تسلسل الجينوم المضيف على مستوى البلاد في هذا الإطار لتسلسل الجينوم لـ 10000 كندي للمساعدة في فهم البنية الجينية لاستجابة المضيف لـ SARSCov-2. تم تكليف CGEn بتطوير الروابط الإقليمية والوطنية والدولية لضمان أن يكون لهذا الاستثمار أقصى تأثير على صحة جميع الكنديين.

مجال البحث

تتطلع لجنة علم الأوبئة الجينية لمشروع CGen HostSeq ( http://www.cgen.ca/project-overview ) الآن إلى بناء فريق من علماء البيانات الموهوبين للعمل معًا لتحديد التباين الجيني الذي يساهم في الإصابة بـ SARS-Cov-2 العدوى والحساسية وشدة مرض COVID-19 من خلال دعم التحقيقات الجارية ومعالجة أسئلة البحث المستقلة. سينضم المرشحون الناجحون إلى فريق من العلماء المعترف بهم دوليًا في علم الأوبئة الجينية وعلم الوراثة الإحصائي وقد يكون مقرهم في فانكوفر أو مونتريال أو تورنتو.

فتحات المركز

حاليًا ، تتطلع اللجنة إلى توظيف إحصائيين وخبراء معلومات حيوية وعلماء أوبئة ومبرمجين وباحثين في الأمراض المعدية وعلماء وراثة بشرية للموظفين أو مناصب زمالة ما بعد الدكتوراه ، ولدينا العديد من الوظائف الشاغرة لهذه الوظائف. قد نطلب إنجاز العمل عن بُعد ، وقد نوفر الوصول إلى أجهزة الكمبيوتر الفائقة والخوادم الآمنة.

المهارات المطلوبة

المهارات المطلوبة لهذه الأدوار هي أي مجموعة فرعية مما يلي:

• خبرة في احتساب بيانات النمط الظاهري المفقودة

• الألفة مع احتساب الوراثي ومراحل (خطوط البرمجيات مثل عزو، SHAPEIT، PHASE وبيغل)

• معالجة تسلسل الجينوم الكامل باستخدام برنامج مثل Burrows Wheeler Aligner أو samtools أو Rainbow أو البرامج ذات الصلة (بما في ذلك حزمة R مثل SNPAssoc و sequinR )

• حساب درجات المخاطر متعددة الجينات

الدراسات جمعية على مستوى الجينوم • استخدام برامج مثل طقطقة، plink2، bgenie، snptest، ldak أو qctool

• دراسات الارتباط على مستوى الجينوم باستخدام تسلسل الجينوم الكامل

• تحليل المتغيرات النادرة والشائعة

• حساب الارتباط الجيني باستخدام برامج مثل LDSC / LDSR أو GCTA أو GEMMA أو phenix

• الشرح الوظيفي للمتغيرات الجينية

• احتواء الأنماط المصلية HLA من تسلسل البيانات

• إدارة قواعد البيانات والمعالجة المسبقة للبيانات في R أو matlab أو Python أو SQL .

• تطوير مواقع الويب ، بما في ذلك تطوير الواجهة الخلفية باستخدام Python أو إدارة خوادم Apache (أو خبرة سابقة في برنامج pheweb)

• تحليل كروموسوم X (معرفة عملية بالتثبيط ، وأشكال وطرق المناطق الصبغية الكاذبة ، ونظام فصيلة الدم XG ، وتحليل الجينوم الكامل لـ X أو التفاعل بين X والمناعة)

مصطلح

مدة العقد تصل إلى سنتين (2). سيكون العقد الأولي عام واحد (1) ، مع إمكانية تمديده إلى عامين بناءً على التقدم المحرز.

المؤهلات المطلوبة

• درجة الماجستير أو الدكتوراه في تخصص ذي صلة.

• خبرة في تحليل البيانات الجينية أو تطوير البرمجيات الجينية.

• أظهر مهارات حل المشكلات وإدارة الوقت ومهارات الاتصال الكتابية والشفوية.

• أظهر القدرة على التفكير والعمل بشكل مستقل في حل التحديات التحليلية.

راتب

سيتم تحديد الراتب بناءً على الوظيفة والخبرة السابقة بالإضافة إلى المزايا.

تعليمات التطبيق

يجب على الأفراد المهتمين بهذه الفتحات تقديم خطاب تغطية يوضح المهارات المحددة التي يمتلكونها (من قسم المهارات المطلوبة أعلاه). يجب عليهم أيضًا سرد اهتماماتهم وخبراتهم في مجال البحث ، وسيرة ذاتية ، ونسخة من ورقة علمية ساهموا فيها مع وصف لدورهم. يجب أن تتناول هذه الرسالة صراحةً الخبرة السابقة في تحليل البيانات الجينية واسعة النطاق ، مثل أداء GWAS ، وحساب درجات المخاطر الجينية ، والخبرة في تصميم الدراسة. يجب على المتقدمين تضمين الاسم وعنوان البريد الإلكتروني لاثنين من الحكام المحتملين والإشارة إلى التاريخ الذي سيكونون فيه متاحين للبدء. يجب تقديم جميع مواد الطلب كملفات PDF في بريد إلكتروني واحد إلى natalie.sun@sickkids.ca . ستبدأ مراجعة الطلب على الفور وتستمر حتى يتم ملء الفتحات. نحن نقدر جميع الاهتمام الذي أعرب عنه بهذه المواقف ولكن سيتم الاتصال فقط بالمرشحين الموجودين في القائمة المختصرة لإجراء مقابلة

ويتم تشجيع جميع المرشحين المؤهلين لتطبيق؛ ومع ذلك ، سيتم إعطاء الأولوية للكنديين والمقيمين الدائمين.

بيان التنوع

يلتزم الفريق بشدة بالتنوع داخل مجتمعه ويرحب بشكل خاص بالطلبات المقدمة من الأشخاص / الأشخاص الملونين ، والنساء ، والسكان الأصليين / السكان الأصليين في أمريكا الشمالية ، والأشخاص ذوي الإعاقة ، والمثليين ، وغيرهم ممن قد يساهمون في زيادة تنوع الأفكار .

بيان إمكانية الوصول

يسعى الفريق ليكون مجتمعًا منصفًا وشاملًا ، ويسعى بشكل استباقي إلى زيادة التنوع بين أفراد المجتمع. ترتبط قيمنا المتعلقة بالإنصاف والتنوع بالتزامنا الثابت بالتميز في السعي لتحقيق مهمتنا الأكاديمية.

نحن ملتزمون بمبادئ قانون إمكانية الوصول لذوي الإعاقة في أونتاريو (AODA). على هذا النحو ، نسعى جاهدين لجعل عمليات التوظيف والتقييم والاختيار الخاصة بنا متاحة قدر الإمكان وتوفير وسائل الراحة كما هو مطلوب للمتقدمين من ذوي الإعاقة.

مؤسسات أخرى


اختر وجهتك الدراسية


اختر البلد الذي توّد السفر إليه للدراسة مجانا أو العمل أو التطوع