ar
منظمة غير ربحية, تصفح الفرص المماثلة
مشرف الدكتوراه: البروفيسور ماري بيير جايجوت
جهات الاتصال: mgaigeot@univ-evry.fr ، راجع أيضًا http://mpgaigeot-research.fr/
مختبر مجموعة الأبحاث "النظرية والنمذجة" LAMBE UMR 8587 ، Laboratoire Analyze et Modélisation pour la Biologie et l'Environnement، Université d'Evry val d'Essonne، Blvd F. Mitterrand، Bat Maupertuis، 91025 EVRY & Université Paris-Saclay - France
الهدف من الكيمياء التحليلية (الحيوية) الحديثة هو تسلسل الجزيئات (الحيوية) والكشف عن هياكلها المجهرية ثلاثية الأبعاد. مقياس الطيف الكتلي (MS) ، أحد الأساليب التحليلية الأساسية في مجال الطور الغازي ، يقترن عادةً (بشكل متعامد) بتقنيات مثل الفصل الكروماتوجرافي والفصل الكهربي ، وقياس طيف الحركة الأيونية (IMS) ، وطرق التنشيط ، والتحليل الطيفي. من بين هذه الوصلات المتعامدة مع مرض التصلب العصبي المتعدد ، يعد التحليل الطيفي للعمل بالأشعة تحت الحمراء (IR) أحد الأساليب القليلة جدًا التي توفر معلومات مباشرة في الهياكل الذرية ثلاثية الأبعاد ، مع نموذج بصمات الأصابع الطيفية 1 إلى 1 العلاقات الهيكلية ثلاثية الأبعاد. شهدت السنوات الخمس الماضية انطلاق مجتمع مرحلة الغاز MS-IR إلى تشغيل التحدي متوسط متوسط- الكيمياء التحليلية الإنتاجية للأوليغومرات الحيوية ذات الصلة بالعمليات البيولوجية. ومع ذلك ، فإن فك رموز توقيعات الأشعة تحت الحمراء (أي مواضع النطاق والشدة والأشكال) في بنية ثلاثية الأبعاد مجهرية لا - تافهة ولا يمكن أن تكون انتهى متفوق من التجارب وحدها للجزيئات المرنة (الحيوية) المعقدة. يجب استخدام حسابات الكيمياء النظرية : وهي خبرة مجموعة Gaigeot من خلال استخدام عمليات محاكاة AIMD / DFT-MD لحساب وتخصيص أطياف اهتزازية غير متناسقة ، للأنظمة الجزيئية المتنوعة للغاية ، مثل جزيئات الطور الغازي والعناقيد والسوائل والواجهات الصلبة / السائلة.
يركز مشروع الدكتوراه هذا على توصيف الهياكل ثلاثية الأبعاد لأوليجومرات الجليكان الكبيرة (جدًا) (ذات الأهمية الكبيرة في التعرف البيولوجي بشكل عام ، والخبرة في مختبرنا) من أجل إجراء التخصيصات 1 إلى 1 المنهجية بين الهياكل و تواقيع IR. تحقيقًا لهذه الغاية ، سيتم تطبيق عمليات محاكاة AIMD / DFT-MD ، جنبًا إلى جنب مع تطبيق أساليبنا المطورة لاستخراج وفك تشفير أوضاع اهتزاز الأشعة تحت الحمراء.
لكي تكون الإنتاجية عالية ويتم تطبيقها بشكل روتيني ، أي يتم تطبيقها في بضع دقائق فقط ، يجب أن يتم فك تشفير توقيعات الأشعة تحت الحمراء في بنية ثلاثية الأبعاد بطريقة نظرية مختلفة تمامًا. نعمل حاليًا على تطوير أساليب نظرية مبتكرة تعتمد على نظرية الرسم البياني ، والتعلم الآلي / العميق ، والذكاء الاصطناعي ، من علوم الكمبيوتر ، في فريقنا ثنائي التخصصات المكون من مجموعة البروفيسور دومينيك بارث في جامعة باريس ساكلاي (خبير في نظرية الرسم البياني والذكاء الاصطناعي. تقنيات). في الدكتوراه الحالية ، سيتم تنفيذ التطبيقات الأولى لهذه الطرق الجديدة لفك تشفير الأشعة تحت الحمراء. إذا كان مهتمًا ، فسوف يشارك طالب الدكتوراه مباشرة في التطورات الجارية لنظرية الرسم البياني وأساليب التعلم الآلي / العميق.
تُستخدم الحزمة CP2K لمحاكاة AIMD ، وتُستخدم الرموز المطورة في مجموعتنا للتحليلات واستخراج الخصائص الهيكلية / الديناميكية / الطيفية من المسارات. للمهتمين ، يمكن النظر في التطورات النظرية و / أو تطوير رموز لتحليلات المسار. تعتبر التطورات التي تتم بالتعاون مع Graph Theory و AI جزءًا من هذا المشروع للمهتمين.
مجموعتنا معترف بها دوليًا في عمليات محاكاة AIMD / DFT-MD لجزيئات الطور الغازي والسوائل والواجهات الصلبة / السائلة. توضح المراجع التالية بعض أعمالنا الأصلية الحديثة والتطورات المبتكرة لطرق التحليل الطيفي للأشعة تحت الحمراء للغاز وطرق نظرية الرسم البياني [Chem. القس 120: 3233-3260 (2020) ، مناقشات فاراداي 217: 67 (2019) ، J. Chem. فيز. 149: 184102-15 (2018) ، ج. كيم. نظرية. الكمبيوتر ، 13: 3802 (2017) ، فيز. تشيم. تشيم. فيز ، 19: 13778 (2017)].
تتكون مجموعتنا من 5 باحثين أكاديميين دائمين ، ومهندس معلوماتية ، و 4 دكتوراه (صينيون ، إيطاليون ، فرنسيون) ، طالب ماجستير واحد بعد الدكتوراه ، طلاب ماجستير M1 / M2 ، زوار أجانب. مجموعتنا معترف بها دوليًا وتمولها العديد من برامج البحث الوطنية الفرنسية ANR و LABEX ، على سبيل المثال ، ANR-NSF الثنائية / الولايات المتحدة الأمريكية ، ANR-DFG / ألمانيا ، LABEX CHARM 3 AT. جامعتنا هي عضو في أكبر جامعة باريس ساكلاي. تقع مدينة إيفري على بعد 45 دقيقة من وسط باريس عبر خط قطار RER D أو 30 دقيقة من باريس ساكلاي عبر الحافلة. تبعد الجامعة مسافة 2 مشي عن محطة RER Evry-Courcouronnes. راجع https://www.univ-evry.fr/accueil.html لمزيد من التفاصيل العملية.
اختر البلد الذي توّد السفر إليه للدراسة مجانا أو العمل أو التطوع
