تحليل البيانات وتصميم التصور للأمراض المعدية الناشئة

تحليل البيانات وتصميم التصور للأمراض المعدية الناشئة

بلجيكا 30 نوفمبر 2021
KU Leuven

KU Leuven

جامعة حكومية, تصفح الفرص المماثلة

تفاصيل الفرصة

جامعة حكومية
المنطقة
البلد المضيف
آخر موعد للتقديم
30 نوفمبر 2021
المستوى التعليمي
نوع الفرصة
التخصصات
تمويل الفرصة
تمويل كامل
الدول المؤهلة
هذه الفرصة متوفرة لجميع البلدان
المنطقة المؤهلة
جميع المناطق

(المرجع BAP-2021-460)

آخر تعديل: الأحد 20 يونيو 2021

يركز مختبر علم الفيروسات التطوري والحاسوبي في قسم علم الفيروسات السريري والوبائي (معهد ريجا ، جامعة لوفين) على العمليات التطورية التي تشكل التنوع الجيني الفيروسي. يشمل هذا عمليات وبائية واسعة النطاق ، مثل النمو السكاني والتشتت المكاني (موضوع شائع في البحث الجغرافي والتطور الحيوي) ، وكذلك تاريخ الانتقال على نطاق صغير والعمليات التطورية داخل المضيف ، بما في ذلك التكيف وإعادة التركيب. هدفنا هو الحصول على رؤى أفضل حول هذه العمليات الجينية التطورية والسكانية وتوضيح كيفية ارتباطها بديناميات الأوبئة والأمراض. لتحقيق هذا الهدف ، نركز على التطورات الإحصائية والحسابية لتحليل الكمية المتزايدة من البيانات الناتجة عن دراسات التسلسل الهائلة ، بشكل أساسي في إطار استدلال علم الوراثة البايزي ، والذي تمتلك مجموعتنا البحثية سجلًا قويًا من أجله. نهدف أيضًا إلى استكشاف إمكانية تطبيق مناهج التصور الجديدة ، من أجل تسهيل تفسير ونشر أبحاثنا.

وحدة الموقع

في الجزء الأول من المشروع ، سيلزم تصميم وتنفيذ تطبيقات برمجية مفيدة تكمل الاستدلال النشئي والتطور الديناميكي البايزي. من أجل ترجمة المخرجات الديناميكية لنماذجنا المقترحة إلى استجابات ملموسة ، سيكون الهدف هو تطوير منصة تصور سهلة الاستخدام وغنية بالميزات وتفاعلية ومرنة على شبكة الإنترنت يمكن تطبيقها بسهولة على مسببات الأمراض المختلفة وتمكين مشاركة هذه تصورات خالية من الاحتكاك قدر الإمكان. منصات تكنولوجيا الويب التي سيتم استخدامها ليست منحوتة في الحجر ويمكن اختيارها شريطة أن تتسع بشكل جيد مع كميات متزايدة من البيانات. تتمتع مجموعة البحث لدينا بخبرة سابقة في هذا المجال ، في تطوير حزمة برامج SPREAD (https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btr481) وخليفتها التي تستخدم المستندات المستندة إلى البيانات: SpreaD3 (https: / /doi.org/10.1093/molbev/msw082). تعتبر معرفة تقنيات الويب الحديثة (انظر وصف الملف الشخصي) ميزة إضافية قوية.

سيشمل الجزء الثاني من المشروع التعرف على عمليات إعادة البناء الجغرافي للتطور الحيوي لبايز على مسببات الأمراض المختلفة ، ولكن مع التركيز الأولي على فيروس داء الكلب. بينما سيركز طالب الدكتوراه المعين سابقًا على تطوير نماذج جديدة للاستدلال الجغرافي ، فإن تطبيق هذه النماذج ومقارنة نتائج الاستدلال ببعضها البعض يشكل مسؤولية مهمة ضمن الوصف الوظيفي الحالي. سيتعين إنشاء مجموعة من مجموعات البيانات المفيدة من مناطق جغرافية مختلفة ، وذلك لمسببات الأمراض المختلفة ، وسيتعين تحليلها بعناية جنبًا إلى جنب مع البيانات الوصفية المتاحة والفرضيات الحالية حول الانتشار الفيروسي في مجال البحث. ومع ذلك ، فإن هذه الأنواع من التحليلات لا تشكل سوى نقطة انطلاق ، ونحن بالتأكيد نرحب بالأفكار الجديدة للتحليلات والنماذج و / أو تطويرات التطبيقات أو مسببات الأمراض المثيرة للاهتمام لدراستها.

يجب أن يكون لدى المرشح لهذا المنصب خلفية في علوم الكمبيوتر و / أو تصميم الويب ، ويفضل أن يكون حاصلاً على درجة الماجستير (بامتياز / بامتياز) و / أو دكتوراه في علوم الكمبيوتر / المعلوماتية (الحيوية) (أو ما يعادلها من خلال الخبرة) . ضع في اعتبارك أن تفاصيل المشروع الممول لا تسمح بتعيين كبار الباحثين بعد الدكتوراه على أساس التفرغ (على سبيل المثال ، يمكن فقط توظيف طلاب الدكتوراه أو الباحثين الذين حصلوا مؤخرًا على درجة الدكتوراه). يُفضل أن يكون المرشح من ذوي الخبرة في واحدة أو أكثر من تقنيات الويب الحديثة مثل JavaScript و HTML و CSS و Python و Data-Driven Documents (https://d3js.org/) و React (http://facebook.github.io/react /) وتطبيق Node.js (http://nodejs.org). يجب أن يكون المرشح ماهرًا بدرجة كافية في اللغة الإنجليزية ، ومتحفزًا للعمل في فريق ونشر النتائج التي توصل إليها ، وعلى استعداد للسفر (عندما تسمح الظروف بذلك).

سيكون المرشح قادرًا على إجراء البحوث في فريق ديناميكي ومتعدد التخصصات (علماء الكمبيوتر ومحللو البيانات وعلماء الأحياء التطورية) ، الموجود في مرافق جديدة تمامًا لمعهد Rega في حرم مستشفى جامعة Gasthuisberg ، ويسترشد بها مشرفون غزير الإنتاج. سيكون المرشح قادرًا على المساهمة في التطوير المستمر لمجموعة تطبيقات BEAST - التي يستخدمها العديد من الباحثين في مجالات علم الوراثة ، وديناميكا التطور ، والتطور الجزيئي ، وتتألف من مجموعة واسعة من أدوات البرمجيات - والتعاون مع كبار الباحثين في هذا المجال . بالإضافة إلى ذلك ، في قسم علم الفيروسات السريرية والوبائية ، سيكون المرشح قادرًا على التفاعل مع العديد من كبار الباحثين في مجال علم الأوبئة وعلم الفيروسات و metagenomics ، والعمل على مشاكل الأمراض المعدية المهمة من منظور تطوري.

سيكون تاريخ البدء المستهدف هو الأول من أكتوبر 2021 ، على الرغم من أنه يمكن التفاوض على تواريخ البدء السابقة واللاحقة ، ويجب على المرشح الحصول على درجة الماجستير و / أو الدكتوراه بحلول ذلك الوقت. يُتوقع من جميع المتقدمين تقديم خطاب تحفيزي ، ونظرة عامة على نتائج دراستهم ومرجعين (مع تفاصيل الاتصال الخاصة بهم). التمويل متاح لمدة 4 سنوات لأداء الدكتوراه ، وما بين 2-3 سنوات في حالة اختيار باحث ما بعد الدكتوراه مبتدئ. سيبقى المنصب مفتوحًا حتى يتم اختيار المرشح المناسب.

يرجى استخدام بوابة الوظائف بجامعة KU Leuven فقط عند التقدم لهذا المنصب. لمزيد من المعلومات ، اتصل بالبروفيسور الدكتور جاي بايلي (guy.baele@kuleuven.be) و / أو الدكتور سيمون ديليكور (simon.dellicour@ulb.be).

يمكنك التقدم لهذه الوظيفة في موعد أقصاه 30 نوفمبر 2021 عبر أداة التقديم عبر الإنترنت

تسعى KU Leuven إلى تعزيز بيئة يمكن أن تزدهر فيها جميع المواهب ، بغض النظر عن الجنس أو العمر أو الخلفية الثقافية أو الجنسية أو الإعاقات. إذا كانت لديك أي أسئلة تتعلق بإمكانية الوصول أو الدعم ، فيرجى الاتصال بنا علىiversiteit.HR@kuleuven.be.

مؤسسات أخرى


اختر وجهتك الدراسية


اختر البلد الذي توّد السفر إليه للدراسة مجانا أو العمل أو التطوع

يمكنك أن تجد أيضا