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PhD: Apprentissage automatique et phytoplancton nocif (H / F)

PhD: Apprentissage automatique et phytoplancton nocif (H / F)

France 02 mai 2021
Ifremer - Institut français de recherche pour l'exploitation de la mer

Ifremer - Institut français de recherche pour l'exploitation de la mer

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DÉTAILS OPPORTUNITÉ

Récompense totale
0 $
Université étatique
Région
Pays hôte
Date limite
02 mai 2021
Niveau d'études
Type d'opportunité
Spécialités
Financement d'opportunité
Non financé
Pays éligibles
Cette opportunité est destiné à tous les pays
Région éligible
Toutes les régions

Référence: PV-2021-901 / 1

Département / Bureau:

Durée du contrat: 3 ans

Date de début:

Date limite de candidature: 02/05/2021

L'Institut et le service recrutement

Pionnier de la science océanique, la recherche de pointe de l'IFREMER repose sur le développement durable et la science ouverte. Notre vision est de faire progresser la science, l'expertise et l'innovation pour:

- Protéger et restaurer l'océan

- Utiliser durablement les ressources marines au profit de la société

- Créer et partager des données, des informations et des connaissances sur l'océan.

Avec plus de 1 500 personnels répartis le long du littoral français sur plus de 20 sites, l'Institut explore les 3 grands océans: les océans Indien, Atlantique et Pacifique. Leader des sciences océaniques, l'IFREMER gère la Flotte océanographique française et ses scientifiques dédiés créent une technologie de pointe pour repousser les limites de l'exploration et de la connaissance océaniques, de l'abîme à l'interface atmosphère-océan.

Bien implantés dans la communauté scientifique internationale, nos scientifiques, ingénieurs et techniciens se sont engagés à faire progresser les connaissances sur les dernières frontières inexplorées de notre planète. Ils fournissent la science dont nous avons besoin pour une prise de décision éclairée et des politiques publiques et ils transfèrent ces connaissances et cette technologie aux entreprises pour répondre aux besoins publics et privés. Au cœur de notre mission est également de renforcer la sensibilisation du public à l'importance de comprendre l'océan et ses ressources, et de responsabiliser les futures générations de dirigeants grâce à des campagnes nationales d'éducation et de sensibilisation.

Créée en 1984, l'IFREMER est un organisme public français et son budget avoisine les 240 millions d'euros. Il fonctionne sous la tutelle conjointe du ministère de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Innovation, du ministère de la Transition écologique et solidaire et du ministère de l'Agriculture et de l'Alimentation.

Domaines de responsabilité généraux

Le Laboratoire Environnement et Ressources de Boulogne-sur-Mer (LER-BL) joue un rôle important dans l'Observation et la Surveillance des écosystèmes côtiers et des ressources exploitées dans l'est de la Manche et la baie sud de la mer du Nord, pour la compréhension de la qualité, structure et fonctions de l’écosystème et, en appui aux politiques publiques. Les activités de recherche et d'expertise du LER-BL sont axées sur les processus d'eutrophisation et leurs conséquences directes ou indirectes sur l'état des écosystèmes, en se concentrant sur la dynamique et la diversité du phytoplancton, en relation avec les impacts anthropiques et les effets du changement climatique. Le LER-BL est membre de la Structure Fédérative «Campus de la Mer», de l'Infrastructure de Recherche Côtière (IR ILICO). Le LER-BL est particulièrement impliqué dans les projets InterReg S3 EUROHAB, H2020 JERICO S3 et CPER MARCO. Il apporte son expertise au Ministère en charge de l'Environnement pour les directives européennes et les conventions des mers régionales.

Résumé

Apprentissage automatique et phytoplancton nocif: définition des états environnementaux favorables aux efflorescences, dynamique de floraison et développement d'un système expert de prévision, d'alerte et de prise de décision

Les écosystèmes marins côtiers évoluent de manière significative en réponse aux changements de modèle et d'intensité des pressions anthropiques qui se produisent depuis des décennies. Les trajectoires de dégradation et de restauration ne correspondent plus nécessairement aux schémas attendus, ce qui rend la définition des mesures de gestion très complexe. Cette thèse vise à caractériser la dynamique du milieu côtier, et plus particulièrement celui du phytoplancton (y compris les efflorescences nocives ou toxiques) en réponse à ces pressions à différentes échelles de temps et d'espace, des événements récurrents à extrêmes, afin de comprendre les processus associés. et de hiérarchiser un ensemble de facteurs de contrôle et de définir des indicateurs et des scénarios pour évaluer cette réponse. L'approche sera donc d'intégrer des méthodes issues du Machine Learning dans un méta-programme, permettant (i) d'optimiser les bases de données de monitoring multi-sources et multi-échelles via la mise en place d'une méthode de complétion de données, (ii) de définir de manière optimale le les statuts environnementaux et de construire une base d'apprentissage via l'approche profonde (multi-level spectral clustering) qui conduira (iii) au développement d'un modèle qui sera le cœur du Système Expert Numérique permettant de prévoir, d'alerter et de conseiller.

L'originalité de ce travail de thèse réside dans la mise en œuvre de méthodes de Machine Learning optimisées couplées à une approche multi-sources, multi-paramètres et multi-échelles anticipant les besoins des Systèmes d'Observation Intégrés de demain. L'approche numérique proposée présente l'avantage d'optimiser la phase de prétraitement des données afin d'exploiter au maximum les informations disponibles, voire de proposer des séries qui seraient inutilisables telles quelles pour l'expert. Au-delà de l'amélioration des connaissances sur la dynamique des efflorescences phytoplanctoniques, en particulier les HAB, et de l'eutrophisation, ce travail de thèse devrait constituer une étape importante d'adaptation aux évolutions technologiques en relation avec la surveillance et l'observation du milieu maritime et devrait nous permettre de proposer un système numérique complet et innovant combinant (i) le regroupement d'états environnementaux multicritères, (ii) un système d'alerte et (iii) un système de prévision. Cette définition des statuts environnementaux et de leur dynamique devrait également nous permettre d'améliorer l'expertise lors des phases d'évaluation de l'état écologique ou environnemental, tel que défini par les directives européennes (DCE, MSFD) ou les conventions marines régionales (OSPAR, Barcelone). Les outils développés et les résultats acquis contribueront à une meilleure définition des objectifs environnementaux et des programmes de mesure, afin de minimiser les effets directs et indirects de l'eutrophisation, en tenant compte des évolutions passées et actuelles en termes de pressions anthropiques et de changement climatique .

Mots clés

Apprentissage automatique, phytoplancton, efflorescence algale nuisible, eutrophisation, observation intégrée, système d'alerte précoce, prévision, expertise environnementale, soutien aux politiques publiques.

Connaissances, compétences et caractéristiques requises

Conditions de travail spécifiques

La thèse est une réelle opportunité de travailler sur les thématiques prioritaires scientifiques et technologiques de l'Ifremer. Il donne droit à un salaire mensuel brut de 1900 euros pour une période de 3 ans, non cumulable avec d'autres bourses.

Comment postuler pour ce poste?

Votre dossier de candidature doit inclure:

Votre demande doit être compilée en 2 fichiers PDF , jusqu'à 1,5 Mo pour chaque fichier:

En cas de problème pour joindre vos documents, merci de télécharger votre CV sur cette page (cette étape est obligatoire pour que votre candidature soit prise en compte) et d'envoyer tous les documents au directeur de thèse: alain.lefebvre@ifremer.fr

La date limite de dépôt des candidatures est le 2 mai 2021. Néanmoins, nous vous encourageons vivement à nous faire part le plus rapidement possible de votre intention de postuler, en contactant le responsable du sujet.

Les contrats des doctorants débuteront à partir du 1 er octobre 2021, sous réserve de la remise des documents administratifs autorisant l'Ifremer à recruter le doctorant (attestation de fin de master 2 ou diplôme d'ingénieur + visa pour doctorants étrangers hors UE).

Comment postuler pour ce poste

Date limite de candidature: 02/05/2021

Toutes les demandes sont traitées exclusivement via notre site Web. Les candidats intéressés peuvent postuler en cliquant sur le bouton «Postuler» .

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